2011年，学院共发表SCI 收录论文35篇，总影响因子113.587。其中《PLOS Pathogens》1篇（IF:9.079）、《PLOS ONE》2篇（IF:4.411）、《Journal of Clinical Microbiology》1篇（IF:4.220）、《Journal of Bacteriology》11篇（IF:3.726）。
2011年，学院教师新承担科研课题共11项，总经费476万元，包括“973”子课题参与1项、国家自然科学基金重点项目1项、国家自然科学基金青年基金项目1项、国家自然科学基金面上项目2项、国家自然科学基金对外交流与合作项目1项、天津市自然科学基金重点项目1项和南开大学基本科研业务费项目4项。新申请获得2012年开始执行课题5项，总经费148万元，包括国家自然科学基金面上项目2项、教育部博士点基金博导类项目1项和天津市自然科学基金一般项目2项。